L'analisi di sopravvivenza è il cuore della maggior parte degli articoli oncologici, ed è il punto su cui mi concentro maggiormente come revisore. Non perché mi piaccia, ma perché è qui che i risultati apparentemente solidi si sgretolano più spesso. Una curva di Kaplan-Meier può sembrare convincente e poggiare comunque su un endpoint mai definito chiaramente, uno schema di censura che distorce silenziosamente il risultato o un hazard ratio ottenuto da un modello la cui assunzione centrale non è mai stata verificata. Quando il reporting della sopravvivenza è approssimativo, un revisore esperto inizia a diffidare del resto dell'articolo. Quando è accurato, segnala che l'intero studio è stato condotto con la stessa cura.
Questa guida mostra come riportare l'analisi di sopravvivenza in modo che un revisore non abbia nulla da segnalare. È scritta dall'altra parte della scrivania. Ogni sezione termina con gli errori specifici che generano un commento, e a volte un rifiuto.
1. Definite gli endpoint prima di tutto il resto
Il problema più comune non è un errore statistico. È un endpoint che non è mai stato definito con precisione. Ogni endpoint di sopravvivenza necessita di tre elementi espressi in termini chiari: la data di inizio (la data indice), l'evento e cosa succede ai pazienti che non hanno mai l'evento.
- Sopravvivenza globale (OS): dalla data indice definita (ad esempio, la randomizzazione, la diagnosi o l'inizio del trattamento) alla morte per qualsiasi causa. L'endpoint più chiaro, perché la morte è inequivocabile.
- Sopravvivenza libera da progressione (PFS): dalla data indice alla progressione della malattia o alla morte per qualsiasi causa, a seconda di quale si verifica prima. È necessario indicare come è stata definita la progressione, ad esempio secondo i criteri RANO in neuro-oncologia o RECIST 1.1 nei tumori solidi.
- Tempo alla progressione (TTP): come la PFS, tranne che le morti senza progressione sono censurate invece di essere conteggiate come eventi. PFS e TTP non sono intercambiabili, e la differenza modifica il risultato.
Un endpoint senza data indice indicata. La progressione descritta solo come “clinica o radiologica” senza criteri nominati. PFS e TTP usati come se fossero la stessa cosa. Si enunci l'inizio, l'evento e i criteri, una breve frase per ciascuno.
2. Censura: dite cosa avete fatto e verificate che sia onesto
La censura significa che un paziente non aveva ancora avuto l'evento quando si è smesso di osservarlo, sia perché lo studio era terminato sia perché il soggetto era perso al follow-up. Due cose devono comparire nell'articolo.
- Quanti pazienti sono stati censurati, e perché. Un tasso elevato di perdita al follow-up è di per sé un risultato che il lettore deve vedere.
- Il follow-up mediano e come è stato calcolato. Il metodo accettato è il Kaplan-Meier inverso, in cui eventi e censure sono scambiati, non semplicemente il tempo di osservazione mediano.
Il problema più profondo è la censura informativa. Il metodo di Kaplan-Meier assume che i pazienti censurati abbiano lo stesso rischio futuro di quelli che rimangono sotto osservazione. Se i pazienti più gravi abbandonano, in modo che la censura sia legata alla prognosi, la curva risulta distorta verso un aspetto migliore della realtà. Non è possibile dimostrare pienamente che la censura non fosse informativa, ma si dovrebbe mostrare di averlo considerato.
Assenza del follow-up mediano, o uno calcolato come semplice tempo di osservazione. Una perdita al follow-up ampia e non spiegata. Nessun accenno in nessun punto al fatto che la censura potrebbe essere informativa.
3. La curva di Kaplan-Meier: le convenzioni che i revisori si aspettano
Una figura di sopravvivenza ha alcuni elementi non negoziabili. Ometterli è il modo più rapido per segnalare inesperienza.
- Una tabella del numero a rischio sotto l'asse delle x. Non è opzionale. Senza di essa il lettore non può giudicare quanto sia affidabile la parte finale della curva.
- Segni di censura su ogni curva, in modo che il lettore veda dove i pazienti sono stati censurati anziché avere un evento.
- La sopravvivenza mediana per ogni gruppo, con il suo intervallo di confidenza al 95%, riportata nel testo o sulla figura stessa.
- Una coda che non viene sovra-interpretata. Una volta che rimangono a rischio solo pochi pazienti, quella parte della curva è la meno affidabile e su di essa non dovrebbero poggiare conclusioni solide.
Assenza del numero a rischio sotto la curva. Autori che traggono conclusioni sicure dall'estrema coda, dove rimangono tre pazienti. Questi due problemi insieme sono i più frequenti che riscontro nelle figure di sopravvivenza.
4. Confronto dei gruppi: log-rank, hazard ratio e l'assunzione che tutti dimenticano
Per confrontare due curve di sopravvivenza si riportano di solito un p-value del test log-rank e un hazard ratio ottenuto da un modello di Cox a rischi proporzionali. Entrambi sono standard. Un passaggio viene saltato troppo spesso.
- Riportare l'hazard ratio con il suo intervallo di confidenza al 95%, non un p-value da solo. “HR 0,62 (95% CI 0,44–0,88, p = 0,007)” dice al lettore la dimensione dell'effetto e la sua precisione. Un semplice “p < 0,05” non dice quasi nulla.
- Verificare l'assunzione di proporzionalità dei rischi. Un hazard ratio di Cox è un numero singolo che assume che il rischio relativo tra i gruppi rimanga costante nel tempo. Se le curve si incrociano o convergono, quell'assunzione è violata e l'hazard ratio è fuorviante. Verificarla, ad esempio con i residui di Schoenfeld o un grafico log-log, e dichiarare di averlo fatto.
- Pre-specificare le covariate in ogni modello aggiustato. Un modello di Cox multivariabile con covariate scelte dopo aver visto i dati è un modo classico per generare significatività artificiale, e i revisori sono addestrati a sospettarlo.
Un hazard ratio senza intervallo di confidenza. Nessuna menzione dell'assunzione di proporzionalità dei rischi, in particolare quando le curve pubblicate si incrociano visibilmente. Un modello multivariabile sospettosamente ordinato senza alcun segno di pre-specificazione.
5. Il bias che affossa gli studi osservazionali: il tempo immortale
Se il vostro studio non è un trial randomizzato, un bias merita una sezione a sé perché è al tempo stesso comune e dannoso. Il bias da tempo immortale emerge quando i pazienti sono raggruppati in base a qualcosa che può accadere solo dopo la data indice, ad esempio “pazienti che hanno ricevuto il trattamento X” rispetto a “quelli che non lo hanno ricevuto.” Il gruppo trattato deve, per definizione, aver sopravvissuto abbastanza a lungo da ricevere il trattamento. Quel tratto garantito di sopravvivenza è il tempo immortale, e fa sembrare il trattamento protettivo quando potrebbe non fare nulla.
La soluzione abituale è un'analisi landmark, in cui i pazienti vengono classificati in base al loro stato in un punto temporale fisso, oppure una covariata tempo-dipendente nel modello di Cox. Se il vostro disegno ha questa struttura, affrontatela prima che lo faccia un revisore. Per un lettore esperto è un campanello d'allarme immediato, e uno non affrontato spesso pone fine alla revisione.
6. Una checklist pre-submission
Prima della submission, verificate che il manoscritto contenga ciascuno di questi elementi.
- Ogni endpoint definito con la sua data indice, il suo evento e la sua regola di censura.
- Criteri di progressione nominati (RANO, RECIST 1.1, o lo standard pertinente).
- Follow-up mediano, calcolato con il metodo Kaplan-Meier inverso.
- Numero di eventi e numero di censurati, per gruppo.
- Curve di Kaplan-Meier con numero a rischio e segni di censura.
- Sopravvivenza mediana con intervalli di confidenza al 95%.
- Hazard ratio con intervalli di confidenza al 95%, mai un p-value da solo.
- Una dichiarazione che l'assunzione di proporzionalità dei rischi è stata verificata.
- Covariate per ogni modello aggiustato pre-specificate e il software statistico con la versione nominati.
Niente di tutto ciò trasforma un risultato debole in uno forte. Ciò che fa è eliminare ogni facile ragione per cui un revisore possa dubitare di voi, in modo che il vostro risultato venga giudicato sulla base dei suoi meriti. Questo è l'intero obiettivo.